排水清淤。首先，应在灾后第一时间排完苗圃积水，以缩短苗木被泡时间。有淤泥覆盖的苗床，要尽量趁退水后泥浆尚软时，边排水边冲洗苗床和苗木，同时疏通地沟，清除淤泥、垃圾等。必要时要安装抽水机冲刷畦面，避免淤泥板结，影响土壤透气性，减少死苗系数。
　　
　　有人认为被洪水冲入田地的淤泥是“油”泥,能增强土地肥力，其实只有彻底翻耕后才能达到增肥的效果。对于已植有苗木而不便翻耕的土地，应及时清除淤泥，无法清除的要及时翻耕和消毒灭菌。
　　
　　查看苗木。对于被淤泥完全湮没的幼苗，需扒开淤泥查看，只要其枝梢和根部没有变成紫褐色，都还有救活的希望，应及时抢救。如果植株枝梢和根部已变紫褐色或已腐烂，则说明苗木已窒息死亡，就没有施救的必要了。
　　
　　没有被淤泥覆盖的苗床，要尽快清除压在苗木上的垃圾等物，抖落或洗除叶芽上粘结的泥土，把倒伏的苗木扶正。大面积被水冲倒，但不露根，又无法扶起的幼苗，可暂不理会，直接做喷淋药肥的工作。
　　
　　防病除草。清淤扶苗工作做完的田块，须立即趁晴天植株表面水分干后喷药防治疫病。可选用植保灵、代森锌、病毒先锋、细菌克斯、杀菌1号等药剂喷施。为了加速苗木恢复生长，可在药剂中掺入一些叶面肥，喷药同时进行叶面施肥。首次喷施之后5至7天再喷一次，一般7至10天后，倒伏的幼苗会完全竖立起来。
　　
　　来不及清淤但便于翻耕的中小苗田块，在淤泥板结后应抓紧时间用锄头等工具将结块的淤泥锄起。已经与原苗床土结合的淤泥，要连原苗床土一并锄起并打碎成小块，但不必太过细碎，以利于土壤透气，能让苗木根系得到呼吸即可。翻土后需及时灌根，或浇淋一次用于防治疫病“药肥水”，用于杀灭淤泥带来的病毒病菌，以利苗木迅速恢复生长。
　
　　被湮没过的地块，其杂草萌生速度很快，因此要精细管理，加倍投入人工进行除草。